Simulaciones masivamente paralelas en dinámica molecular
2020Descargar versión completa (PDF)
Profesores: Dr. Jesús Enrique Díaz Herrera (UAM Iztapalapa) y Dr. Manuel Aguilar Cornejo
Resumen: La mecánica estadística y el poder de cómputo actual provee una descripción formal conocida como: experimento computacional o simulación molecular, que hoy juega un papel muy importante y es aquí donde surge la necesidad de recurrir a la construcción de modelos moleculares, que es una representación matemática que nos permite la descripción a nivel microscópico de un sistema macroscópico.
Objetivo general:
- Diseñar e implementar, usando clústers de GPUs y CPUs, un simulador masivamente paralelo en dinámica molecular que resuelva las ecuaciones de movimiento de traslación y orientación de partículas con interacciones no esféricas.
Objetivos específicos:
- Realizar un estudio de los modelos en dinámica molecular a simular
- Realizar un estudio del modelo de programación paralela usando clústers de GPUs
- Realizar un estudio del manejo de los diferentes niveles de memoria cache de los GPUs para acelerar la ejecución de nuestras simulaciones
- Diseñar y desarrollar el simulador masivamente paralelo
Ultima actualización 13/08/2022 por pcyti